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Yan 的杂物志_个人主页分享
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Bland-Altman图
Created2023-02-18|2_Note0_Technic2_算法3_数据分布
介绍 Bland-Altman 图是一种一致性评价测量方法,简称 BA,常用于医学实验和数据分析。 可使用它检测两组数据的一致性,比如对比新旧两种方法,对比一组实际值和预测值等。相对于校准曲线,它能更好地对比两组数据中每个数据对的一致性。 如何看图 图中每个点代表一个实例,其横轴是预测值和实际值的均值,纵轴是其预测值与实际的差值。两条红线分别表示 mean±1.96std 的范围。若大部分样本点落在此范围内,则说明两种方法的测量一致性较好。如上图中最右侧的点,假设它的预测值是 1,实际值是 0.93,则其均值是 0.965(即横坐标),其差值是 0.07(即纵坐标)。 通过看图可以得到一些结论,如: 可以从图中点看出数据的分布; 如果图中点均分布在 0 附近,则说明一致性高; 如果左边密集,右边分散,则说明值越小误差越小; 从 Y 轴可以看出,数据是往上偏还是往下偏。 实现 Python 的 pingouin 和 pyCompare 包都提供 BA 作图工具,也可以使用 matplotlib 直接画图,详见: Bland-Altman Plots(一致性评价)在python中的实 ...
论文阅读_AlphaGo_Zero
Created2023-02-17|2_Note0_Technic2_算法15_强化学习
journal: Nature name_ch: 在没有人类知识的情况下掌握围棋游戏 name_en: Mastering the game of Go without human knowledge paper_addr: http://www.nature.com/articles/nature24270 date_publish: 2017-10-01 读后感 AlphaGo Zero 是 AlphaGo 的改进版本,之前版本都使用有监督学习和强化学习相结合的方式。如题——它与之前版本不同的是不需要通过学习人类棋手的下法,其 Zero 意思是无师自通。其核心算法是将价值网络和策略网络二合一,并在卷积网络中加入残差。 介绍 文章分两部分,第一部分介绍其整体,第二部分展示了算法细节和一些背景知识(在参考资料之后)。 AlphaGo 是深度强化学习的精典应用范例,围棋领域之所以复杂是因为:在广阔的搜索空间中,需要有精确而精细的前瞻性。 AlphaGo 的第一个版本,简称 AlphaGo Fun,指 2015 年战胜樊麾的版本;它使用两个神经网络:价值网络和策略网络。其中的策略网络一开始 ...
列线图工具_Nomogram
Created2023-02-11|2_Note0_Technic2_算法3_数据数据分析
定义 列线图是一种相对传统的分析方法,用于展示自变量和因变量的线性关系,及其特征的重要程度。 现在用 SHAP,和机器学习库中的 Feature importance 工具可以实现类似甚至更好效果。不过很多传统的研究领域比较认这种方法。 列线图工具建立在多因素回归分析的基础上,将多个预测指标进行整合,然后采用带有刻度的线段,按照一定的比例绘制在同一平面上,从而用以表达预测模型中各个变量之间的相互关系。 原理 先使用多因素回归(逻辑回归,Cox 回归)得出的结果,然后根据回归系数算出 Nomogram 及画图。 处理流程 主要操作流程如下: 数据处理: 去掉共线性特征(VIF 判断多重共线性) 去掉单因素分析中不显著的特征 去掉加了和不加对模型没什么影响的特征(LASSO 回归) 做多因素回归 用回归结果做 Nomogram,将结果图形化 怎么看图 Points:第一行是标尺 前几行是特征重要性 Total Points: 所有指标加在一起的得分 Risk:对应风险值 工具 R 语言实现方法,详见:Nomogram图不会画?看了这篇,小白也能轻松看懂搞定 Python 没有 N ...
数据分析工具_SuperSet
Created2023-02-11|2_Note0_Technic2_算法3_数据数据分析
介绍 SuperSet 是一款开源可视化 BI(商业智能)Web 应用程序。它通过创建和分享 dashboard,为数据分析提供了轻量级的数据查询和可视化方案。其优点如下: 不需要自己去搭服务,写前端页面,直接生成分析图 可接入多种数据源 安装方便,学习成本较低 安装 使用 docker 安装启动方法如下: 12345678910111213docker search supersetdocker pull amancevice/superset # 星最多,最新版的mkdir -p /opt/module/docker/superset/conf mkdir -p /opt/module/docker/superset/data# 启动docker run --name superset -u 0 -d -p 8088:8088 -v /opt/module/docker/superset/conf:/etc/superset -v /opt/module/docker/superset/data:/var/lib/superset amancevice/superset# 进入 ...
论文阅读_图形图像_U-NET
Created2023-02-08|2_Note0_Technic2_算法8_图形图像AI绘画
英文名称: U-Net:Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation 中文名称: U-Net:用于生物医学图像分割的卷积网络 论文地址: http://link.springer.com/10.1007/978-3-319-24574-4_28 出处:journal: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention–MICCAI 2015 时间: 2015 1 读后感 本文主要针对的问题是优化生物医学图像领域的图像识别,之前图像模型往往需要数千张标注图片训练。而医学影像数据往往存在图片大,图片中内容多(比如一张图中可能有很多的不正常细胞),难以做几千张图片的标注,除了正常异常,还常常需要标出具体位置。之前的方法是用滑动窗口将图像切成小块训练,这种方法比较慢图像重叠造成冗余,还要根据具体情况考虑切分方法,才能在上下文和效率之取得平衡。 文中提出的解决方法是:设计了U 型网络结构和训练策略,相对于普通的卷积网络,增加了右侧的上采样卷积,从而恢复图像。 最 ...
蓝思指数
Created2023-01-08|2_Note0_Technic0_工具其它
1 蓝思指数 蓝思阅读指数,所谓的 Lexile(蓝思指数),是美国科学基金会 (National Science Foundation,United States 简称 NSF) 为提高学生的阅读能力,而研究出的一种衡量学生阅读水平和标识书籍难易程度的一套标准。 2 地址 http://lexile.com 3 分级表 Pasted image 20221207185918.png 4 查书的难度 https://hub.lexile.com/find-a-book/book-results 5 计算段落的难度 Analyzer 工具,可以免费测试 250 个单词以内的段落的蓝思值。 https://hub.lexile.com/analyzer 6 问题 英语是拼读语言,大部分单词符合拼读规则。蓝思指数源自美国,对于英语是母语的人,看到拼写基本会读,会读就知道大概意思。而很多单词我们能大概拼出来也不知道是什么意思。 找了几篇难度在 700 左右的文章,看了看觉得难度差异非常大,感觉用这个直接给娃找书……仅供参考吧。
文献工具_Zotero
Created2023-01-08|2_Note0_Technic0_工具笔记工具zotero
之前一直用在线的 readpaper 看论文,可是文献一多,就觉得分类功能比较弱,也不太好找,另外没办法做整篇笔记,也不能和笔记工具连起来,有点难受。 昨天同事推荐了 Zotero 和 Endnote,看了几篇文章都说 Zotero 比 Endnote 好用,另外,它还能导出 Obsidian Note,在 O 和 Z 之间互相跳转,以及和 Chrome 结合。 1 简介 Zotero 用于收集、组织、引用、分享各类资料,支持网页版,注册账号之后在多端自动同步以及使用浏览器插件。 2 用后感 安上后发现除了论文还支持书籍文献等等功能。感觉 Zotero 覆盖了之前使用软件的所有功能,软件版本也更稳定,翻译也很流畅。 3 安装 Linux 版本 3.1 下载 https://www.zotero.org/ 3.2 安装 12345678910tar xvjf Zotero-6.0.19_linux-x86_64.tar.bz2mv Zotero_linux-x86_64/ /opt/cd /opt/Zotero_linux-x86_64/chmod 777 zoterochmod 777 ...
论文阅读_深度强化学习综述
Created2023-01-03|2_Note0_Technic2_算法15_强化学习
journal: IEEE Conference on Industrial Electronics and Applications (ICIEA) name_ch: 深度强化学习:简要概述 name_en: A Brief Survey of Deep Reinforcement Learning date_publish: 2017 读后感 本篇介绍包含:应用场景;基于策略的和基于价值的不同方法;具体算法包含:DQN,TRPO,AC。 这个文章,感觉中间那部分比较乱,结构比较乱,内容也只是皮毛,定义也没讲清楚,也不够深入,最后一部分还行。 1. 介绍 强化学习主要针对:自主的智能体通过与环境交互学习最优行为,通过试错随着时间的推移而改善模型。 之前方法伸缩性差,且主要解释低维问题,深度学习算法近年的发展,借助其函数逼近和表示学习(高维状态和动作空间的降维&分层表示)的能力,能更好解决上述问题。 典型的应用场景,如从视频游戏的帧像素学习玩游戏,又如混合有监督学习和强化学习的 AlphaGO(结合了监督,强化学习和传统的启发式搜索算法),还有机器人等等。 2. 奖利驱动行为 ...
论文阅读_医学异常检测综述
Created2022-11-13|2_Note0_Technic2_算法10_异常检测
英文题目:Deep Learning for Medical Anomaly Detection - A Survey 中文题目:深度学习的医疗异常检测综述 论文地址:https://arxiv.org/pdf/2012.02364.pdf 领域:深度学习,异常检测 发表时间:2021.04 作者:Tharindu Fernando,澳大利亚昆士兰科技大学 出处:ACM Computing Surveys 被引量:1024(谷歌学术) 代码和数据: 阅读时间:22.11.09 1 读后感 主要讨论在医疗数据中使用深度学习方法,以处理影像数据,时间序列为主,同时讨论了医学数据一些特有的属性。 2 介绍 2.1 什么是异常 异常检测的主要任务是识别不符合总体数据分布的数据样本。在医疗领域,除了建模以外,对模型的解释也至关重要。在实际应用中,对异常的定义也比较复杂,比如行为的不一致性;区分噪声与异常;还需要考虑上下文对异常的影响。 2.2 医疗异常的不同 模型在医疗领域的应用包括两部分:诊断(识别当前状态)和预测(未来的状态),这两部分都可能发生异常。 Pasted image 2022 ...
论文阅读_深度学习异常检测
Created2022-11-13|2_Note0_Technic2_算法10_异常检测
英文题目:Deep Learning for Anomaly Detection: A Review 中文题目:基于深度学习的异常检测综述 论文地址:https://arxiv.org/pdf/2007.02500.pdf 领域:异常检测,深度学习 发表时间:2020.01 作者:Guansong Pang,阿德莱德大学 出处:ACM Comput. Surv. 被引量:697(谷歌学术) 代码和数据:见论文附录 A 阅读时间:2022.11.05 全文翻译:https://blog.csdn.net/pingguolou/article/details/117421638 1 读后感 本篇解读的论文发表于 2020 年,主要介绍基于深度学习的异常检测技术,可作为 2009 年发表的那篇高引的传统异常检测综述的互补。前三章主要是相关问题和挑战(1-3 章)。从第四章开始总结了近年来深度异常检测的具体方法,共 3 大分类(4-6 章),11 个小分类。分别对关键直觉,目标函数,基本假设,优势劣势,及应对挑战方法进行讨论。最后讨论了未来的机会,还提供了大量文献列表和训练数据集,实用性强。本 ...
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Yan.xie
顺流而下还是逆流而上?
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